常规化学合成的siRNA序列为21~23nt的双链小分子RNA,为冻干粉形式的即用型试剂,在常温不溶解的情况下可以保存至少1个月时间,放置于-20℃~-80℃低温环境中,冻干粉可以稳定保存一年。
试剂配置:收到冻干粉剂后,2000rpm短暂离心,将粉剂离到管底,在超净工作台上喷洒RNA酶去除剂清除实验桌面和离心管等实验耗材表面的RNA酶污染,使用无RNA酶枪头吸取RNase-free water溶解到实验浓度(1-100nM),分装成100μl/管,-20℃储存。
实验(本次选择小鼠基因VEGF进行RNAi研究):
1、siRNA设计合成:NCBI搜索小鼠VEGF的基因信息,使用设计软件设计出的siRNA序列,送合成公司合成,具体信息如下:
2、接种细胞:将RAW264.7细胞接种到6孔板中,细胞数为2×104。
3、在进行下述转染步骤前,把培养有细胞的六孔板每孔换成2mL新鲜培养液(含有血清和抗生素的完全培养液)。
4、取一个洁净无菌离心管,对于待转染的六孔板中每一个孔的细胞,加入125µl不含抗生素和血清的DMEM培养液(高糖DMEM或低糖DMEM均可) 加入100pmol siRNA,并用枪轻轻吹打混匀;再加入4µl LipoRNAi转染试剂,用枪轻轻吹打混匀,请特别注意不可涡旋或离心。配制完成后,室温存放6小时内稳定。(如果发现有细胞毒性,可以把转染试剂的用量在2-4μl范围内进行适当调节,siRNA用量可以在50-250pmol的范围内进行适当调节,具体情况根据所研究的基因决定)。
5、将配制好的siRNA转染复合液加入各细胞孔中,摇动培养板,轻轻混匀。37℃,5% CO2培养箱培养,直至发挥干扰作用,实验分组为空白组、无关对照组(无关siRNA)、实验组1、实验组2和实验组3。
6、培养约2天左右后,收集细胞,使用RT-qPCR和Western-Blot检测siRNA对于靶基因VEGF的下调效果。CCK-8检测siRNA转染后对细胞增殖的影响。
7、RT-qPCR
8、Western blot:
9、CCK-8: